Gyvenvietės ir kaimai: Karmėlava, Bagdonava, Biruliai, Būdos I, Būdos II, Būdos III, Būdos IV, Būdos V, Daukliūnai, Didysis Raistas, Drąseikiai, Gireliai, Girininkija I, Girininkija II, Guldynai, Išorai, Kalnėnai, Kaukazas, Krėslynai, Kungušilai, Margava, Mikainiai, Mikoliškiai, Narėpai, Paskutiškiai, Pašiliai, Peleniai, Ramučiai, Rykštynė, Rudmena, Salupiai, Sergeičikai I, Sergeičikai II, Sunkiniai, Svilonėliai, Sviloniai, Šafarka, Šešuva, Šileikos, Turžėnai, Užusaliai, Vaistariškiai, Veseluvka.
Karmėlavos Šv. Onos parapija ribojasi su Kauno Šv. apaštalų Petro ir Povilo (Arkikatedros bazilikos), Domeikavos, Lapių, Kulvos, Jonavos, Rumšiškių, Kauno Švč. M. Marijos Rožančiaus Karalienės (Palemono), Kauno Gerojo Ganytojo (Dainavos) ir Kauno Pal. Jurgio Matulaičio (Eigulių) parapijomis bei Kaišiadorių vyskupija.
Pagal Kauno Arkivyskupo metropolito Sigito Tamkevičiaus 2003 m. balandžio 2 d. dekretą Nr. 206.